Неприятный запах клоповника отпугивает клопов, благодаря этому свойству получил свое название. Пучки этого растения вешают на стены и кладут в постель для отпугивания клопов.

Весной и летом охотно поедается верблюдами, удовлетворительно овцами и козами. Не поедается лошадьми и свиньями.

Является одним из лучших кормов для кроликов, поедается до осени. Особенно хорошо кролики поедают семена, которые, вероятно, могут заменять концентрированные корма. Экспериментальные данные показывают эффективность введения семян клоповника мусорного в рацион кроликов: прибавка в весе группы из 3-х кроликов, рацион которых состоял из 100 г сена, 100 г свеклы и 30 г семян клоповника, составил 128,3 г, тогда как группы, рацион которых состоял из 100 г сена, 100 г свеклы и 30 г овса составил лишь 47,4 г.

Расчетная урожайность семян при очень густом стеблестое может составлять 0,8-1,2 т/га (расчеты, вероятно, преувеличены).