Горчица полевая является серьезным конкурентом для сельскохозяйственных культур, особенно для яровых, реже озимых, культур, свеклы, бобовых и рапса, среди которого она может остаться незамеченной. Помимо использования влаги и питательных веществ, семена полевой горчицы снижают качество масла рапса.

На создание 1 кг сухого вещества горчица полевая потребляет 870-900 л воды (транспирационный коэффициент). 

Может проявлять подавляющие аллелопатические свойства на ячмень.

Ядовит (Баздырев).

Молодые растения безвредны, ядовитые свойства проявляются в фазе цветения и начале образования семян. Семена ядовиты из-за содержащегося в них синигрина. При поедании животными в больших количествах в указанных фазах приводит к отравлениям, в том числе с летальным исходом (Дударь): в колхозе им. Сараева (Петровский район, Ставропольский край) при скармливании коровам зеленой массы озимой пшеницы с большой долей горчицы полевой в фазе цветения и образования семян привело к отравлению нескольких десятков голов, часть животных прирезали. Также отмечались случаи отравления лошадей, крупного рогатого скота и других животных при скармливании люцерны, эспарцета или соломы, засоренных большим количеством сорняка в фазе цветения и образования семян (например, в Днепропетровской области). У свиней отмечались отравления при загрязнении кормов (зерноотходов) семенами горчицы полевой. Поэтому в кормовых целях участки, засоренные сорняком, могут использоваться только до фазы цветения горчицы, когда она слабоядовита (Дударь).

В семенах и листья горчицы полевой содержится горчичное масло, а также глюкозид синигрина. Энзим мирозиназа расщепляет минигрин с образованием глюкозы, сульфата калия и аллилового горчичного масла (0,18%). Аллиловое горчичное масло имеет резкий раздражающий запах, вызывает раздражение кожи. В зеленой массе содержатся алкалоиды. Отмечаются отравления и падеж лошадей при поедании сена, содержащего от 24 до 71% горчицы полевой. Симптомы отравления лошадей: угнетенное состояние, повышенная температура тела, колики, понос, одышка, усиленное и ускоренное дыхание, судорожный кашель, судорожное подергивание мышц, расширение зрачков, пенистая жидкость из носа. Причина гибели — удушение сильнейшим кашлем. Отравление свиней отмечались при поедании корма с примесью 2,4% семян горчицы полевой к зерну ячменя. У животных наблюдались снижение аппетита, понос, учащенное и затрудненное дыхание, слабость, дрожь, в течение суток — гибель. Вероятно, ядовито для все домашних животных: при поедании больших количеств гибель наступает сразу, при небольших количествах — в течение 15-20 дней. При поедании коровами, молоко приобретает редечный вкус.

Служит резерватором для некоторых возбудителей грибных заболеваний и специализированных для семейства Крестоцветные (Brassicaceae) насекомых-вредителей.