Todos los fertilizantes orgánicos se caracterizan por sus efectos duraderos, por lo que, a la hora de determinar la eficiencia agronómica y económica, hay que resumir los aumentos de rendimiento fiables para todos los años, al menos durante 3-4 años. Los costes de preparación, compra, almacenamiento, transporte, manipulación, cosecha y acabado deben asignarse en proporción a los aumentos de rendimiento resultantes para todos los cultivos que recibieron estos aumentos.

La eficacia económica de los abonos orgánicos depende de la distancia de transporte, en el caso de los diluidos con agua (semilíquidos, purines, lodos y aguas residuales) de la dilución: cuanto más lejos esté el transporte y mayor sea la dilución, menos rentable y, a veces, menos rentable es la tecnología. Incluso en el caso del transporte por tuberías o de la utilización de abono para el riego, el abono se diluye con agua en la aplicación directa: en la cámara de mezcla y en la corriente de transporte por tuberías.

La dilución del estiércol para, por ejemplo, durante la hidrolimpieza, y durante el almacenamiento requiere la construcción de estanques de almacenamiento con una buena impermeabilización. Por lo tanto, es económicamente viable en las granjas y complejos recibir y almacenar estiércol en lugar de efluentes de estiércol.

La eficacia económica de los abonos orgánicos también depende de las condiciones del mercado de productos agrícolas.

La máxima consideración de todos los factores económicos permite la determinación más razonable de todos los recursos disponibles de fertilizantes orgánicos por rotación de cultivos y parcelas fuera de la finca, y dentro de ellos — teniendo en cuenta la acción y los efectos posteriores en virtud de la más rentable en los aspectos agronómicos, económicos y ecológicos de los cultivos.

La tasa y el grado de descomposición de los abonos orgánicos dependen del enriquecimiento de los suelos con microorganismos, de su composición y de su actividad biológica, así como de las condiciones que determinan su actividad vital: estructura y aireación del suelo, regímenes hídricos, térmicos, de nutrientes y propiedades físicas y químicas.

La intensidad de la mineralización de los abonos orgánicos viene determinada por su biogenicidad. Así pues, el estiércol es una sustancia biológicamente activa; es rico en microorganismos, una tonelada contiene hasta 13 kg de microbios vivos. La turba, en cambio, es pobre en microorganismos y, por tanto, se descompone lentamente en el suelo. Por ello, se añaden sustancias biológicamente activas como estiércol, purines y heces para acelerar el proceso de descomposición, es decir, se preparan compostas orgánicas.