На основе изозимных полос Puchalski и Robinson (1990) классифицировали виды Cucurbita в семь филогенетических групп. C. moschata и C. argyrosperma были включены в одну группу, а другие культивируемые виды были помещены в разные группы. Несмотря на то, что они находятся в одной филогенетической линии, C. moschata и C. argyrosperma, вероятно, были одомашнены от разных диких предков, как и другие культивируемые сквоши. Оригинальная филогения, предложенная Puchalski и Robinson (1990), подтверждается анализом геномных последовательностей (Montero-Pau et al., 2017).

Большинство видов Cucurbita происходят из Северной или Центральной Америки, но несколько видов, включая C. maxima, родом из Южной Америки. Поскольку дикие плоды этого рода горькие и несъедобные, ранние собиратели, вероятно, сначала собирали плоды ради их съедобных семян или для использования прочной кожуры в качестве тары. Эти способы использования в конечном итоге привели к одомашниванию видов со съедобными плодами. С этих истоков сквош, наряду с кукурузой и бобами, стал основным продуктом питания в рационе цивилизаций ацтеков, инков и майя в Латинской Америке.

Согласно археологическим данным, дикие популяции C. pepo в Мексике и на востоке США появились около 5000-10 000 лет назад (Smith, 1997a). C. pepo, был самым древним из одомашненных на юге Мексики и юго-западе США еще в 8000 году до нашей эры. Одомашнивание этого вида, очевидно, происходило независимо в этих двух областях (Decker, 1988), причем одомашнивание в восточной части США произошло примерно на 5000 лет позже, чем одомашнивание в Мексике (Smith, 2006). Американские сорта ssp. ovifera (L.) Decker var. ovifera, к которым относятся различные кабачки и большинство декоративных тыкв, вероятно, были отобраны в основном из диких популяций var. ozarkana Decker-Walters, обитающих в долине Миссисипи. Однако популяции в Техасе (var. texana (Scheele) Decker) и северо-восточной Мексике (ssp. fraterna (Bailey) Andres) также могли внести свой вклад в генетическую эволюцию этих сортов. Дикий прародитель мексиканской линии культурных сортов (ssp. pepo), которая включает тыквы и овощные кабачки, в настоящее время неизвестен и, возможно, вымер (Decker-Walters et al., 1993). Интересно, что в течение нескольких тысяч лет между C. pepo var. pepo и C. pepo var. ovifera не произошло интрогрессии генов, хотя миграции людей наверняка имели место, а регионы одомашнивания были не так уж далеки друг от друга.

C. pepo был первым видом тыквы, завезенным в Европу. Он появляется в Livre d’Heures d’Anne de Bretagne, иллюстрированной между 1505 и 1508 годами (Paris et al., 2006). Изображения плодов и цветов тыквенных форм C. pepo присутствуют на вилле Фарнезина в Риме в фестонах растительности, разделяющих спандрели, и были проиллюстрированы между 1509 и 1517 годами (Janick and Paris, 2006). Только после публикации «Di Historias Stirpium» Фукса (1543 г.) любой из видов Cucurbita появился в гербариях. Некоторые плоды, изображенные в древних европейских гербариях, не отличаются от современных сортов. Изысканные детальные изображения, дающие представление о диверсификации C. pepo в Европе и происхождении форм летнего сквоша, можно увидеть на картинах Антуана Николя Дюшена (Париж, 2000). Вторичная диверсификация сортов тыквы и овощного комара произошла в Малой Азии (Paris, 2001). Сегодня C. pepo выращивается по всему миру.

C. moschata культивировалась в Мексике, Южной Америке и юго-западной части США в доколумбовы времена. Возможно, она была одомашнена независимо в Мексике (в 5000 году до н.э.) и на севере Южной Америки; ее уникальность заключается в том, что она распространена в двух разных родных областях — основной в Мексике и незначительной на севере Южной Америки (Whitaker and Bemis, 1975). Однако дикий предок C. moschata в настоящее время неизвестен. Археологи обнаружили следы C. moschata на перуанских стоянках, датируемых 4000-3000 гг. до н.э., и на мексиканских стоянках, датируемых 1440-400 гг. до н.э., что свидетельствует о длительной истории одомашнивания и культивирования. Как культурное растение, этот вид мигрировал по островам Карибского бассейна, породив различные местные сорта калабасы. Когда он достиг Флориды, коренные американцы вывели отдельный сорт под названием «тыква семинолов». Дополнительная диверсификация сортов произошла в некоторых районах Азии и Африки. Сообщалось об изображениях C. moschata на вилле Фарнезина, относящихся к началу XVI века (Janick and Paris, 2006), но в целом иллюстраций этого вида в художественных произведениях и гербариях Европы меньше.

C. argyrosperma, по-видимому, была одомашнена в южной Мексике, где археологические свидетельства культивирования датируются 5100 лет назад (Smith, 1997b). Дикие популяции ssp. sororia (Bailey) Merrick & Bates, которые встречаются в Мексике и Центральной Америке, дали начало одомашненному подвиду (ssp. argyrosperma). Возможно, сначала были отобраны ландрасы ssp. argyrosperma var. argyrosperma. Две другие группы сортов, var. callicarpa Merrick & Bates и var. stenosperma (Pang.) Merrick & Bates, вероятно, произошли от северных и южных сортов var. argyrosperma, соответственно (Merrick, 1990). Сорные популяции var. palmeri (Bailey) Merrick & Bates считаются побегами var. callicarpa, которые могли подвергнуться интрогрессии с ssp. sororia. Сегодня C. argyrosperma культивируется в Мексике, Латинской Америке, Карибском бассейне, юго-западной части США и Азии, но имеет меньшее коммерческое значение, чем C. pepo, C. maxima или C. moschata.

C. maxima ssp. andreana (Naud.) Filov, горькоплодный уроженец Аргентины и Уругвая, о чем свидетельствуют раскопанные семена, датируемые 1200 г. н.э. (Vishnu Swarup, 2006), является диким прародителем одомашненного ssp. maxima, и эти два вида легко гибридизируются. Впервые этот вид был встречен испанцами, когда их исследования достигли тихоокеанского побережья Южной Америки в XVI веке, и вид, по-видимому, проиллюстрирован в Villa Farnesina (Janick and Paris, 2006; Formiga and Myers, 2019). Виды C. maxima не достигали Северной Америки, пока не были привезены парусными судами из Южной Америки на северо-восток США в XVIII веке. Один из ранних интродуцентов был назван «Вальпараисо», предположительно из этого города в Чили. Хорошо приспособленные к умеренному климату, виды C. maxima были особенно популярны в северных штатах США, Канады и Европы. Сегодня C. maxima культивируется по всему миру, причем значительные объемы производства приходятся на Южную Америку, Индию и Африку. Кабоча (Kabocha, buttercup) является огромной статьей экспорта в Азию как для Мексики, так и для Новой Зеландии, а C. maxima ‘Jarradale’ (голубой/серый сквош корончатого типа) является тыквой, выращиваемой для местного потребления в Новой Зеландии и Австралии. Также широко культивируется в Турции, а в Польше в течение нескольких лет ведется селекция C. maxima, включая использование сортов в качестве корма для крупного рогатого скота. Поскольку этот вид в целом более холодостойкий, чем C. argyrosperma, C. moschata и C. pepo, его можно выращивать в более высоких широтах и на больших высотах.

C. ficifolia называют малабарской тыквой, поскольку когда-то считалось, что она азиатского происхождения. Однако, как и другие тыквы, ее происхождение находится в Америке, вероятно, в высокогорных горных районах Мексики. Этот холодостойкий вид, растущий на высоте до 2600 м, в доисторические времена культивировался также в горах Анд в Перу. Он попал в Азию на парусных кораблях вскоре после начала Колумбийского обмена. Плоды имеют твердую кожуру и длительный срок хранения (хранятся до 2 лет) и могли выдерживать длительные морские путешествия. Малабарская тыква редко выращивается в промышленно развитых странах, разве что в качестве корневища, на которое прививают огурец. Однако в Латинской Америке этот вид является овощем под названием «замбо», а также кормом для скота. Даже плоды диких растений собирают и употребляют в пищу (Andres, 1990).